UNUD Open Repository

UNUD Open Repository provides access and discovery to the University of Udayana publications and digital collections. It contains digitized and digital version of theses, dissertations, research reports, and articles produced by academic communities in this university.

Alternatif Penggunaan Silika Bentonit Sebagai Pengganti Fenol-Klorooform-Isoamil alkohol Dalam Ekstraksi DNA secara LAngsung dari TAnanh Hutan Mangrove

Ir. Wahyu Dwijani Sulihingtyas,M.Kes., WAHYU DWIJANI SULIHINGTYAS (2016) Alternatif Penggunaan Silika Bentonit Sebagai Pengganti Fenol-Klorooform-Isoamil alkohol Dalam Ekstraksi DNA secara LAngsung dari TAnanh Hutan Mangrove. Jurnal Kimia (Journal of Chemistry), 10. ISSN 1907-9850

[img] Archive
a8b68e7220ac33ad0cd1475af2307413.pdf

Download (0B)

Abstract

ALTERNATIF PENGGUNAAN SILIKA BENTONIT SEBAGAI PENGGANTI FENOL-KLOROFORM-ISOAMIL ALKOHOL DALAM EKSTRAKSI DNA SECARA LANGSUNG DARI TANAH HUTAN MANGROVE Khisan Qamariya, Wahyu Dwijani Sulihingtyas, dan I Nengah Wirajana* Jurusan Kimia FMIPA Universitas Udayana, Bukit Jimbaran, Bali *E-mail : nwirajana@gmail.com ABSTRAK Telah dilakukan penelitian tentang perbandingan ekstraksi DNA metagenomik dari tanah hutan mangrove dengan fenol-kloroform-isoamil alkohol dan silika bentonit. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengetahui perbedaan kualitas dan kuantitas DNA metagenomik hasil ekstraksi menggunakan fenol-kloroformisoamil alkohol dibandingkan dengan silika bentonit setelah mengalami proses lisis secara langsung dari tanah hutan mangrove. Penggunaan fenol-kloroform-isoamil alkohol tidak memenuhi konsep Green Chemistry, sehingga dalam penelitian dicoba diganti dengan silika bentonit. DNA metagenomik hasil ekstraksi dari dua teknik ini diuji dengan elektroforesis gel agarosa dan spektrofotometri UV-Vis. Hasil elektroforesis gel agarosa terhadap DNA metagenomik menunjukkan bahwa DNA relatif lebih banyak terkandung pada supernatan pertama dari ekstraksi dengan silika bentonit; namun diperoleh keutuhan DNA yang relatif sama seperti DNA hasil ekstraksi dengan fenolkloroform- isoamil alkohol. Hasil analisis dengan spektrofotometri UV-Vis menunjukkan bahwa rasio A260/230 DNA hasil ekstraksi dengan fenol-kloroform-isoamil alkohol memiliki tingkat kemurnian relatif lebih tinggi terhadap asam humat. Rasio A260/280 DNA metagenomik hasil ekstraksi dengan silika bentonit pada elusi terakhir menunjukkan tingkat kemurnian relatif terhadap protein yang tertinggi daripada yang lain. Kata kunci : tanah mangrove, DNA metagenomik, silika bentonit ABSTRACT Research on comparing the metagenomic DNA extraction from mangrove forest soil with phenolchloroform- isoamyl alcohol and with silica bentonite was conducted. The purpose of this study was to find the differences in quality and quantity of metagenomic DNA extracted. The silica bentonite was compared to meet the Green Chemistry concept. The metagenomic DNA from these extractions were analyzed by agarose gel electrophoresis and UV-Vis spectrophotometry. The results of electrophoresis showed that metagenomic DNA extracted with silica bentonite were relatively higher in concentration than with phenol-chloroform-isoamyl alcohol; but integrity of their DNA were the same. The results of UV-Vis spectrophotometry analysis showed that A260/230 ratio of the phenol-chloroform-isoamyl alcohol extract had higher relative purity level to humic acid. The A260/280 ratio of the final elution of the silica bentonite extraction showed the highest relative purity level to protein. Keywords : Mangrove soil, Metagenomic DNA, silica bentonite

Item Type: Article
Uncontrolled Keywords: -
Subjects: L Education > L Education (General)
Divisions: Faculty of Law, Arts and Social Sciences > School of Education
Depositing User: Mr. Repository Admin
Date Deposited: 07 Jun 2016 21:58
Last Modified: 21 Jun 2016 05:58
URI: http://erepo.unud.ac.id/id/eprint/1661

Actions (login required)

View Item View Item